ชั้นล่างสุด เป็นรูปโรงเรียน หมายถึง พระปริยัติสัทธรรม
ชั้นกลาง เป็นรูปพระพุทธรูปปางสมาธิ หมายถึง พระปฏิบัติสัทธรรม
ชั้นบนสุด เป็นรูปพระบรมธาตุรัชมังคลาจารย์สมานฉันท์ของวัดท่าตอนพระอารามหลวง ซึ่งเป็นสถาปัตยกรรมที่เป็นความภูมิใจของชาวอำเภอแม่อาย หมายถึง พระปฏิเวธสัทธรรม
และภายใต้รูปโรงเรียน มีบทพุทธพจน์ว่า สุตํ ปญฺญาย วฑฺฒนํ เป็นปรัชญาประจำโรงเรียน โดยมีชื่อโรงเรียนพระปริยัติธรรมวัดท่าตอนอยู่นอกวงกลมอีกชั้นหนึ่ง